Зоной ответственности филиала стала территория Новгородской и Ленинградской областей, а также Республика Карелия. Первым директором Центра защиты леса Новгородской области стал Владимир Иванович Косенко.
В 2007 году территория Ленинградской области и Карелия отошли к вновь созданному Центру защиты леса Ленинградской области, а Псковская область передана Новгородскому центру защиты леса.
В 2007 году филиал начал работы по закладке сети пунктов постоянного наблюдения для проведения лесопатологического мониторинга по системе ICP-Forests, всего было заложено 148 пунктов постоянного наблюдения по Новгородской и 109 по Псковской областям.
К этому времени коллектив Центра значительно увеличился за счёт создания отдела защиты леса и лесопатологического мониторинга, а также информационно-аналитического отдела. В 2007 году был создан отдел «Новгородская лесосеменная станция». Отдел был оснащён современным оборудованием для определения посевных качеств семян лесных растений и их фитопатологического анализа.
В 2010 году директором филиала был назначен Александр Анатольевич Порохов.
Филиал продолжил проведение работ по лесопатологическому мониторингу, лесопатологическим обследованиям и семенному контролю. За счёт сокращения в 2014 году отдела сертификации и почвенно-химического отдела был увеличен штат инженеров-лесопатологов.
27 сентября 2016 г. директором филиала назначен Роман Николаевич Глебов.
Филиал ФБУ «Рослесозащита» - «ЦЗЛ Новгородской области» осуществляет свои полномочия на территории Новгородской и Псковской областей. Площадь лесного фонда Новгородской области составляет более 3 миллионов га, Псковской – более 2 миллионов га.
В настоящий момент в состав ЦЗЛ Новгородской области входят следующие подразделения профильной направленности:
- отдел защиты леса и государственного лесопатологического мониторинга;
- новгородская лесосеменная станция;
- информационно-аналитический отдел.
Коллектив филиала успешно выполняет работы по ведению государственного лесопатологического мониторинга. Регулярная сеть пунктов постоянного наблюдения на территории Новгородской области включает 166 ППН, на территории Псковской области – 132 ППН.
Выполняются также работы по государственному мониторингу воспроизводства лесов, оценке посевных качеств семян лесных растений, проведению агрохимических обследований в лесных питомниках.
В последние несколько лет активно развиваются различные виды проектно-изыскательской деятельности, такие как: проектирование лесных питомников в зонах ответственности филиала, разработка проектов освоения лесов. Филиал участвует в подготовке проектов нормативных документов. Ведутся работы по мониторингу на территориях, расположенных вокруг промышленных предприятий. Проводятся лесопатологические обследования, экспертизы и консультации.
В рамках популяризации деятельности учреждения ведётся активная работа со СМИ.
Кадровый состав Филиала сложился из квалифицированных специалистов, обладающих достаточным потенциалом и способностью решать задачи в своей профессиональной деятельности. Фактическая численность коллектива в настоящее время составляет – 32 человека.
В целях усиления кадрового состава Филиала ФБУ «Рослесозащита» - «ЦЗЛ Новгородской области» организовано сотрудничество с кафедрой лесного хозяйства Института сельского хозяйства и природных ресурсов Новгородского Государственного Университета имени Ярослава Мудрого (далее НовГУ). Среди сотрудников Филиала имеются выпускники НовГУ, а студенты проходят практику на базе Филиала.
Ряд сотрудников филиала за большой вклад в развитие службы защиты леса награжден почетными грамотами ФБУ «Рослесозащита» и памятными нагрудными знаками («За сохранение и преумножение лесных богатств», «80 лет службе защиты леса», «Почетный работник лесного хозяйства», «10 лет службы в государственной лесной охране Российской Федерации».
Сведения о директорах филиала
Косенко Владимир Иванович – руководил филиалом со дня основания (2002 год) до 2010 года.
Порохов Александр Анатольевич
Закончил биологический факультет Новгородского государственного университета, кандидат биологических наук, защитил диссертацию на тему: «Реакклиматизация и биоценотическая роль речных бобров Castop fiber L. на территории Приильменской низменности».
Руководил Центром защиты леса Новгородской области с 2010 по 2016 год.
Глебов Роман Николаевич
Закончил Лесохозяйственный факультет Санкт-Петербургской государственной лесотехнической академии им. С.М.Кирова.
Работал инженером-таксатором на Северо-Западном лесоустроительном предприятии, С.-Петербург. Лесничим в ФБУ «Сосновское лесоохотничье хозяйство» в Ленинградской области.
Руководил филиалом ФБУ «Рослесозащита» - «ЦЗЛ Ленинградской области» с 2008 по 2016 год», с 2016 года возглавляет ЦЗЛ Новгородской области. Награжден почетной грамотой Федерального агентства лесного хозяйства и памятным нагрудным знаком «80 лет службы защиты леса», медалью МЧС РФ «За усердие».